直接扣工资不合理。依据《劳动法》，用人单位不得克扣劳动者工资，且离职盘点缺货需另寻解决途径。若不及时处理，可能导致劳动者权益受损，引发劳动争议。
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处理此问题可协商或法律途径解决。建议先与用人单位沟通，若无法达成一致，可选择劳动仲裁、投诉或起诉等法律手段维护自身权益。
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扣工资不合理。处理方式：1.与用人单位协商，明确责任与赔偿；2.若协商无果，向劳动监察部门投诉，提交相关证据；3.也可直接申请劳动仲裁，通过法律程序维权；4.必要时可提起诉讼，确保合法权益得到保障。