员工是否需要赔偿需视情况而定。依据《药品经营质量管理规范》，药品近效期需下架，具体期限按药店规定。若员工违规销售导致损失，则需赔偿。未及时下架近效期药品，可能引发顾客投诉、药店信誉受损及法律纠纷。
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员工是否赔偿视具体情况。操作如下：1.核查药品销售记录，确认是否近效期销售；2.若销售，查看是否告知顾客有效期；3.依据《药品经营质量管理规范》及药店制度，评估员工责任；4.如员工违规，按规定处理赔偿事宜，确保合法合规。
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处理员工赔偿药店近效期药品问题，常见方式有调查事实、依据规定处理。应先核实员工是否违规销售，再参照药店管理制度及《药品经营质量管理规范》决定是否需要赔偿，确保处理公正合理。