公司合并员工不愿去，应依据法律规定考虑补偿。依据《劳动合同法》，若满足条件，员工可获经济补偿，按工作年限计算。不及时处理可能导致员工不满，影响企业声誉和稳定。
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公司合并员工不愿去，应补偿。具体操作：1.与员工沟通，了解不愿合并原因，尝试调整岗位或提供培训；2.若员工仍坚持不愿，评估是否满足《劳动合同法》补偿条件；3.若满足，按工作年限计算补偿金，与员工签订协议；4.确保补偿金及时、足额发放，避免法律纠纷。
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公司合并员工不愿去，常见处理方式是协商或依法补偿。应先与员工协商，了解意愿，尽量通过调整岗位或提供培训解决。若协商不成且满足法律条件，则依法给予经济补偿。